A diferencia de las moléculas inorgánicas, estas contienen uno o mas átomos de carbono que se unen con enlaces covalentes o con átomos de hidrógeno.
Estas están echas con carbono, hidrógeno, oxigeno, y nitrógeno y entre ellos hay lipidos, proteínas, carbohidratos y ácidos nucleicos los compuestos orgánicos son polímeros o macromoleculas formadas por monomeros pequeñas unidades los principales "polímeros" son las proteínas y los polisacáridos
Las orgánicas se caracterizan por tener una gran masa molecular en cambio las inorgánicas tienen un mayor nivel de energía química.